в ubuntu нажимаем alt+f2 (диалог запуска команды) и вводим dconf-editor
находим в /org/gnome/meld/ ключ detect-encording
убираем у него отметку use default value
и вводим [‘UTF-8’, ‘WINDOWS-1251’]
все — теперь корректно выводятся символы в cp1251